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数据资源包括微生物资源及编目数据、基因组、宏基因组数据、生物安全等共计61个数据库，资源总量超过2PB，数据记录数超过40亿条。重点数据库：全球微生物菌种目录数据库已收录全球48个国家的129个保藏机构的45万菌株保藏信息。全球模式菌株全基因组数据库，五年内完成万种细菌、真菌模式等菌种的测序，并完成标准开发、数据平台、数据挖掘等工作。